Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja3Q64448 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja3Q64448 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja3Q64448 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms