Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp248Q640N4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp248Q640N4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp248Q640N4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp248Q640N4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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