Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga3Q62470 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga3Q62470 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga3Q62470 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms