Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Supt6hQ62383 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt6hQ62383 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt6hQ62383 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt6hQ62383 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms