Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sptbn1Q62261 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn1Q62261 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.7 ms