Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgfb1i1Q62219 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgfb1i1Q62219 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1i1Q62219 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.3 ms