Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn9aQ62205 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn9aQ62205 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn9aQ62205 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms