Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssr4Q62186 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssr4Q62186 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms