Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd55bQ61476 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd55bQ61476 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms