Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msi1Q61474 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi1Q61474 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi1Q61474 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms