Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsx2Q61412 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vsx2Q61412 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms