Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AcanQ61282 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AcanQ61282 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms