Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
JrkQ60976 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms