Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Meis1Q60954 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis1Q60954 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis1Q60954 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms