Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppp1r1bQ60829 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r1bQ60829 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms