Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a1Q60737 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a1Q60737 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms