Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SkilQ60665 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SkilQ60665 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms