Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2f1Q60632 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nr2f1Q60632 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms