Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CttnQ60598 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CttnQ60598 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms