Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sin3aQ60520 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sin3aQ60520 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sin3aQ60520 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms