Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema5bQ60519 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5bQ60519 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms