Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a4Q5XF90 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp13a4Q5XF90 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a4Q5XF90 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms