Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms