Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf1Q5U4C3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf1Q5U4C3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf1Q5U4C3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms