Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdcp1Q5U462 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms