Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnajc11Q5U458 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnajc11Q5U458 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnajc11Q5U458 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnajc11Q5U458 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms