Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NotoQ5TIS6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NotoQ5TIS6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms