Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Specc1Q5SXY1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Specc1Q5SXY1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Specc1Q5SXY1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms