Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myh1Q5SX40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myh1Q5SX40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myh1Q5SX40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms