Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms