Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TefmQ5SSK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms