Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utp18Q5SSI6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp18Q5SSI6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms