Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam46cQ5SSF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam46cQ5SSF7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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