Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tom1l2Q5SRX1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tom1l2Q5SRX1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tom1l2Q5SRX1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms