Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rtp3Q5QGU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms