Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttf2Q5NC05 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms