Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vps41Q5KU39 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vps41Q5KU39 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms