Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp36l3Q5ISE2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp36l3Q5ISE2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms