Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DroshaQ5HZJ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DroshaQ5HZJ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DroshaQ5HZJ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms