Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf3Q5HZG4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf3Q5HZG4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf3Q5HZG4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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