Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtl5Q5DTT4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtl5Q5DTT4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms