Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms