Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndufaf2Q59J78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndufaf2Q59J78 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndufaf2Q59J78 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms