Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eme2Q56A04 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eme2Q56A04 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms