Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3lQ4KL14 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc3lQ4KL14 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms