Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Brinp3Q499E0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brinp3Q499E0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms