Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc27Q3V036 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc27Q3V036 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms