Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrfip1Q3UZ39 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms