Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnpc3Q3UZ01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnpc3Q3UZ01 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms