Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc55Q3UY51 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc55Q3UY51 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms